ムルティストラーダ1200Sには、「スポーツエディション」と「ツーリングエディション」が用意されている。

スポーツエディションには、カーボンファイバー製フロントエアインテーク、カムベルトカバー、リアマッドガード、サイドエアダクトを標準装備する。

ツーリングエディションには、ヒーテッドグリップ、サイドラゲージ、センタースタンドを標準で装備する。

さらに、Ｓバージョンでは、ABSブレーキシステム、電子制御によってアジャストされるDES(ドゥカティエレクトロニックサスペンション)を標準設定している。